Немного позже Теркен Хатун предложила дяде Беркярука пост вали Азербайджана Исмаилу б. Якути восстать против султана. Они потерпели поражение от Беркярука в битве при Кередже (август 1093) и вынуждены были вернуться к Теркен Хатун. Однако, Исмаил не смог договориться с эмирами его окружения и отправился к сестре матери Беркярука Зюбейде Хатун. Он был убит эмирами, из-за того, что вынашивал в себе плохие замыслы против Беркярука (сентябрь-октябрь 1093 года). Теркен Хатун и после этого не отказалась от идеи прибрать к своим рукам султанат какой-либо области. Таким образом, она позвала в Исфахан Царя Сирии Тутуша, который тоже хотел занять престол. Тутуш, когда узнал о смерти своего брата Меликшаха, занял город Ракка и провозгласил здесь себя султаном (февраль 1093 года).
Он, подчинив вали Урфы – Бозана, вали Халеба – Аксунгура, и вали Антакьи – Яги-басана, после завоевания Рахбе, района Хабур, Нусейбина и Мусула (апрель 1093 года), для того, чтобы сесть на Сельджукский престол, направился в Азербайджан. Однако, Эмир Аксунгур и Бозан перешли на сторону Беркярука и силы Тутуша заметно ослабли, по этой причине, для пополнения своей военной мощи, он вынужден был вернуться назад в Дамаск (декабрь 1093 года). Беркярук в это время вошел в Багдад, где была прочитана молитва с упоминанием его имени (май 1094 года). Немного позже Тутуш, собрав новое войско, снова перешел к действиям, вначале он решил отомстить Эмиру Аксунгуру и Бозану за недавнюю измену. Схватив их, он убил этих двух эмиров (май 1094 года).
Тутуш на пути к Азербайджану взял под свое господство район Ахлят и отправился к Хемедану. Теркен Хатун хотела присоединиться к нему, но заболела и не смогла осуществить это и умерла в Исфахане (сентябрь-октябрь 1094 года). С другой стороны, Беркярук с малым количеством воинов потерпел поражение от передовых отрядов Тутуша и спрятался в Исфахане. Получив известие об этом поражении, халиф Аббасидов Мустахзир Биллях в Багдаде прочитал молитву с упоминанием имени Тутуша. Беркярук был схвачен в Исфахане эмирами его брата Махмуда.
это время Махмуд умирает от оспы (октябрь-ноябрь 1094 года), что стало причиной того, что эмиры признали Беркярука султаном. Окончательная битва между Беркяруком и Тутушем состоялась 26 февраля 1095 года в районе города Рей. Большая часть эмиров и солдат, которые, из-за плохого отношения Тутуша к ним, были на него злые, присоединились к Беркяруку. В результате Беркярук выиграл эту битву, а Тутуш был убит на поле боя.