Для взятия трона, шах Джихану потребовалось разбить своих братьев в борьбе за трон. После вступления на престол, дабы предотвратить развал империи и последующую междоусобицу, казнил всех мужчин своей династии. Подавляет восстание афганских управителей, захватывает Девлетабад, Гульканд, Миджапур, Тибет. Европейцы при его правлении, еще более расширили свои связи с Индией.
Шах Джихан имел четырех сыновей. Воспитывая их способность к руководству, назначил их правителями нескольких регионов, подготавливая таким образом к правлению всего государства. В 1458 году шах Джихан тяжело заболел и еще при его жизни началась борьба за трон между его сыновьями, в которой победителем выходит пленивший в том же 1658 году сначала отца, потом и брата Мурада, Эвренг, севший на трон под именем Алемгира I .
При правлении шах Джихана империя переживала расцвет в искусстве, политике и архитектуре. Шах посылал послов и к Мехмеду IV, падишаху Османской Империи, для заключения военного договора против сафевитов, но не добился результата. Однако присланные из Стамбула архитекторы построили непревзойденный по своей красоте, великолепное архитектурное сооружение, мавзолей «Тадж-Махал». Главным архитектором являлся Мехмед Иса Эфенди, лучший архитектор Османской Империи того времени. Шах Джихан приказал построить эту гробницу для любимой жены, умершей при родах, Мумтаз Махал. Сам шах Джихан похоронен в той же гробнице.