Хана на его место в 1257 году пришел его младший брат Берке Хан. Берке Хан начал печатать на монетах свое имя, таким образом, объявляя свою независимость от Каракумов. Так же построил новую столицу империи Новый Сарай. В то время потомки Чингиза впали в раздор между собой, началась борьба за престол Великого Каганата. Берке Хан использовал эту ситуацию, в войне за престол сначала поддержал Артык Боке. Однако победителем стал Кубиляй Хан, и поэтому, отношения с Великим Каганатом совершенно ослабли.
После раздела империи Чингиз Хана земли Хорезма были отданы во владения Чагатай хану, эти земли теперь назывались страна Чагатай или Улус Чагатай. Теперь там правил Хан Алгу. Когда Берке Хан находился в походе на Кавказ, Алгу Хан, расширил свои владения, нарушил границу между странами, поэтому, отношения между ханами стали недружелюбные. Также он вынужден был воевать с правителем илханов Хулагу, который захватил Кавказ. Оба родственных правителя хотели овладеть богатыми землями Азербайджана. Поэтому, между ними началась кровопролитная война. В этой войне Берке Хан полностью разбил войска Хулагу хана. Война с ильханами подтолкнула Берке Хана на более тесные отношения с мамлюками правящими в Египте, которые были родом из территорий кыпчаков.
Заключив дружественный договор с Бейбарсом, Берке Хан направился на Византию. В 1265 году, отправил 20-тысячное войско во главе с племянником Ногаем на юг Дуная. Там было разбито и уничтожено войско Византии. В этом походе был освобожден Кейкавус Второй, заточенный в Стамбуле и отправлен в Крым.